Gloria Ofoegbu gjorde första målet och Piteå IFs Francisca Ordega ökade till 2-0 efter ett solonummer när hon först dribblade av två Namibia-backar och sedan rundade målvakten.
Matchens dominant från första till sista minuten var emellertid Sunnanås Perpetua Nkwosha.
Nigeria vann därmed sin grupp och är klart för semifinal.