Japan som blev tvåa efter USA i VM 2015 var favoriter på hemmaplan men kunde inte stå emot Australien vars lagkapten Lisa de Vanna gav Australien ledning i den 25:e minuten.
Lisa slog också den öppnande passningen till Michelle Heyman som rundade målvakten och utökade ledningen till 2-0 fem minuter före paus.
Yuki Ogimi gav hemmalaget lite hopp när hon reducerade för Japan strax innan domaren blåste för halvtidsvila.
Japan tryckte på men lyckades inte göra mål det gjorde istället Katrina Gorry som nickade in 3-1 till Australien i den 78:e minuten vilket också blev slutresultatet.