Sara Back nickade in 1-0 för Sirius på Tempest-Marie Norlins inlägg och Caroline Lundberg ökade till 2-0.
Astrid Larsson missade ett bra läge att reducera för Älta strax före halvtidsvilan.
Ingrid Wixner kunde ha stängt matchen för Sirius och hennes skott inte prickat ribban.
Lina Malmborg tände hoppet för Älta när hon reducerade till 1-2 och kvitteringen hängde i luften under matchens sista minuter.
– En rätt typisk match efter ett uppehåll. Maskineriet hackade lite och vi fick inte till matchplanen helt. Vi hade en bra period i första och en i andra och sedan hade vi mindre bra perioder. När vi på allvar var på gång i andra halvlek fick vi ett olyckligt mål emot oss och det blev spännande på slutet. En tuff bortamatch och det känns meriterande att vinna här, säger Sirius tränare Olof Unogård till klubbens hemsida.