Med 2-1-segern fick FFC Frankfurt revansch på Turbine Potsdam som vann Bundesliga.
Svenja Huth gav Frankfurt ledningen efter en kvart.
Tre minuter före halvtid kvitterade Yuki Nagasato för Turbine Potsdam som då hade etablerat tryck mot Frankfurt-försvaret. Det stod alltså 1-1 i halvtid.
FFC Frankfurt började bäst efter paus och bara tre minuter in på andra halvlek kunde Kerstin Garefrekes slå in målvaktsreturen från Birgit Printz skott.
Lagkapten Nadine Angerer fick ta emot pokalen av prisutdelaren Tysklands president Christian Wulff som lovordade båda lagen, samtidigt som han ser fram emot sommarens VM-slutspel.
Både FFC Frankfurt och Turbine Potsdam erhåller 70.000 euro i prispengar, drygt 650.000 S kr vardera.