Åter en knapp förlust för Hammarby i slutminut liksom i Damallsvenskan.
Klara Lindberg nickade in 1-0 för Djurgården efter en kvart.
– Sedan blev vi litet försiktiga och bjöd in Hammarby i matchen. Vi missade två frilägen, berättar Djurgårdens tränare Daniel Kalles Pettersson.
Efter att Nazanin Vaseghpanah kvitterade i 70:e minuten gled försiktigheten över till Hammarby.
Det avgörande målet kom efter en omställning där Freja Hellenberg på en fri yta hittade Sarah Michel som gjorde segermålet.