AIK tog ledningen genom Lilja Björk.
Hammarby kvitterade på straff genom Ellen Gibson och hade sedan två bollar inne i AIK-målet som blev bortdömda.
När 12 minuter återstod gjorde Hanna Droh AIKs segermål.
Starkt av AIK som hade 120 minuters match från lördagen bakom sig.
Båda lagen bjöd trots det på offensiv fin fotboll.
Magda Ericsson och Jenny Holapa kom att bilda ett riktigt bra mittbackspar i Hammarby den här matchen och målvakt Isabella Granlund utmärkte sig också.